Aquellas cuyo hábitat característico está particularmente amenazado, en grave regresión, fraccionado o muy limitado. Su declaración conlleva la redacción de un Plan de Conservación del Hábitat en el que se indiquen así mismo las directrices y medidas necesarias para asegurar su conservación.

En esta categoría se incluyen 25 especies amenazadas:

 

 

Nombre Común	Nombre Científico
Malvavisco común	Althaea officinalis
Apio rastrero	Apium repens
Estrella de agua	Callitriche palustrise
Centaurea de Somiedo	Centaurium somedanum
Milhojas de agua	Ceratophyllum demersum
Coclearia de los Pirineos	Cochlearia pyrenaica
Espigadilla de mar	Crucianella maritima
Rocío del sol de hoja larga	Drosera anglica
Cola de caballo de bosque	Equisetum sylvaticum
Junco lanudo	Eriophorum vaginatum
Lechetrezna de playa	Euphorbia peplis
Helecho juncal	Isoetes velatum
Junco cantábrico	Juncus cantabricus
Junco filiforme	Juncus filiformis
Acelga salada	Limonium vulgare
Mielga marina	Medicago marina
Nenúfar amarillo pequeño	Nuphar luteum subsp. pumilum
Potentilla arbustiva	Pentaphylloides fruticosa subsp. floribunda
Borraza, hierba salada	Spartina maritima
Sosa blanca, espejuelo	Suaeda maritima
Sosa prima	Suaeda vera
Lentibularia menor	Utricularia minor
Seda de mar ancha	Zostera marina
Salicor duro, sosa alacranera	Sarcocornia fruticosa